Die Ludwig Boltzmann Gesellschaft erhält die Basissubventionen von den folgenden Institutionen:

• Bundesministerium für Wissenschaft und Forschung: 3,6 Mio Euro pro Jahr
• Nationalstiftung für Forschung, Technologie und Entwicklung: 2,5 Mio Euro pro Jahr
• Stadt Wien: 1 Mio Euro pro Jahr

Weitere Finanziers sind die institutionellen Partnerorganisationen der Ludwig Boltzmann Institute. Bei den über Ausschreibung gegründeten LBI wird zu 60% durch die Ludwig Boltzmann Gesellschaft und zu 40% von den institutionellen Partnerorganisationen des jeweiligen Instituts getragen. Das Gesamtbudget der LBG stammt je zu rund 50% von Basissubventionen sowie von den institutionellen Partnern und Drittmitteln (EU-Grants, FWF-Projekte etc.).